彦根城博物館は、1987年に彦根市制50周年記念事業の一環として開館した歴史博物館。
彦根藩主を代々務めた井伊家に伝わる美術工芸品や古文書など45,000点ほどの資料の他、彦根や彦根藩の資料も合わせ、約91,000点の資料を収蔵している。常設展「“ほんもの”との出会い」では、1～2か月ごとに展示品を入れ替えながら、甲冑や刀剣などの武具、能面や能装束、茶道具、雅楽器、調度品、古文書などを展示している。
彦根城博物館の建物は、彦根藩の政庁であった彦根城表御殿を古絵図や発掘調査結果などをもとに復元したもので、能舞台や茶室、藩主の居間など表御殿内部の様子も見ることができる。